Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp235Q499D5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms