Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc114Q3UX62 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc114Q3UX62 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms