Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn4Q3UV66 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms