Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms