Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms