Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc34Q3UI66 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms