Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttll12Q3UDE2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms