Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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