Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TchpQ3TVW5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TchpQ3TVW5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms