Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc136Q3TVA9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms