Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc4Q3TR08 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms