Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc102aQ3TMW1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms