Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
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