Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1EQ15878 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1EQ15878 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1EQ15878 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1EQ15878 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1EQ15878 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1EQ15878 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1EQ15878 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1EQ15878 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1EQ15878 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1EQ15878 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1EQ15878 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1EQ15878 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1EQ15878 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1EQ15878 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1EQ15878 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1EQ15878 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1EQ15878 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1EQ15878 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms