Protein–RNA interactions for Protein: Q149F5

Tmem71, Transmembrane protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem71Q149F5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tmem71Q149F5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tmem71Q149F5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tmem71Q149F5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tmem71Q149F5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tmem71Q149F5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem71Q149F5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms