Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lingo4Q149C3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms