Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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Spatc1Q148B6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Spatc1Q148B6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Spatc1Q148B6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Spatc1Q148B6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Spatc1Q148B6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Spatc1Q148B6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Spatc1Q148B6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spatc1Q148B6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Spatc1Q148B6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Spatc1Q148B6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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