Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam83bQ0VBM2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms