Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBB0

Prelid2, PRELI domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid2Q0VBB0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prelid2Q0VBB0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms