Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms