Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gata4Q08369 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms