Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb2Q08331 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms