Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms