Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms