Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms