Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RelaQ04207 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelaQ04207 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms