Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms