Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfiaQ02780 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms