Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms