Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms