Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gbp1Q01514 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms