Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited1P97769 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited1P97769 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cited1P97769 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cited1P97769 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited1P97769 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms