Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sparcl1P70663 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms