Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms