Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms