Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx1P70314 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms