Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps17P63276 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps17P63276 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps17P63276 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps17P63276 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps17P63276 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps17P63276 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps17P63276 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms