Protein–RNA interactions for Protein: P62313

Lsm6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm6P62313 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lsm6P62313 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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