Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms