Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms