Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms