Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpa1P57784 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms