Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtnsP57757 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtnsP57757 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtnsP57757 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtnsP57757 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtnsP57757 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtnsP57757 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtnsP57757 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms