Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CckbrP56481 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CckbrP56481 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CckbrP56481 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CckbrP56481 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CckbrP56481 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CckbrP56481 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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