Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aqp4P55088 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms