Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Map3k1P53349 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms