Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Lbx1P52955 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Lbx1P52955 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Lbx1P52955 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Lbx1P52955 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Lbx1P52955 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Lbx1P52955 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Lbx1P52955 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lbx1P52955 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lbx1P52955 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lbx1P52955 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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Lbx1P52955 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lbx1P52955 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lbx1P52955 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lbx1P52955 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lbx1P52955 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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