Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Upp1P52624 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp1P52624 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp1P52624 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp1P52624 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp1P52624 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp1P52624 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp1P52624 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp1P52624 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp1P52624 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms