Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e3P52483 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e3P52483 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e3P52483 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e3P52483 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2e3P52483 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2e3P52483 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms