Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnfP51944 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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CcnfP51944 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnfP51944 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CcnfP51944 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CcnfP51944 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnfP51944 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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